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关于WGCNA关联性状分析介绍

2024-09-06

       WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系,以及网络中的核心基因。适用于复杂的数据模式,推荐5组(或者15个样品)以上的数据。一般可应用的研究方向有:不同器官或组织类型发育调控、同一组织不同发育调控、非生物胁迫不同时间点应答、病原菌侵染后不同时间点应答。如在公司同时做生理指标检测可免费提供WGCNA分析,可快速找到核心基因和重要基因,以及关键生理指标或者环境因子,用于后续分析,大大降低分析难度分析内容包括:1.模块的功能富集,2.模块与性状之间的相关性,3.模块与样本间的相关系数。挖掘模块的关键信息:1.找到模块的核心基因,2.利用关系预测基因功能。

WGCNA关联分析.png




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